答案ACD
解析本题考查公文的基本知识。
A项正确，发文办理中运转的是公文的文稿，保存完好的公文文稿对全面准确地反映公文的形成过程十分重要。对政策性文件的修改稿、领导审改稿等底稿，要保存好原件，与正式文件一并归档，当选。
B项错误，草稿是供讨论、征求意见、修改审核、审批时用的原始的非正式文稿，不具备正式公文的效用，除重要法规性公文及重大事项公文的草稿需要归档保存外，一般公文的草稿不需要归档保存，排除。
C项正确，发文办理中要将有关审核、审签、签发的全部材料保存齐全，特别是签发人的签署件，要确保完好。如遇特殊情况需传真到外地请领导同志签发公文时，事后要请其正式补签，不可只保存传真复印件，当选。
D项正确，联合发文需要会签，有的部门在会签时会附上专门的会签意见，有的会在送请会签的文稿上修改，这些都必须原貌保存，防止缺漏，当选。
故正确答案为ACD。
